Post-doctoral position on population PK at CEA Saclay (France, Paris region) to model human drug metabolism

Dear colleagues, Please find below the description (in French and English) of a 2 year post-doctoral position in our laboratory focusing on population pharmacokinetic modelling of drug metabolism. Do not hesitate to contact me for further information. Best regards, Etienne Thevenot. # Français #--------- Post-doctorat au CEA-Saclay : Mathématiques appliquées à la modélisation de la pharmacocinétique et du métabolisme des médicaments chez l'homme I. Poste à pourvoir Contexte du projet Le CEA ( http://www.cea.fr/ ) est un organisme pluridisciplinaire à vocation principalement technologique dont l'un des axes forts porte sur les technologies de l'information et de la santé. Le projet s'inscrit dans le programme transverse "technosanté" du CEA. Il regroupe plusieurs laboratoires appartenant à la direction des sciences du vivant (pour les aspects biologie et pharmacologie) et à la direction de la recherche technologique (pour la modélisation statistique). La connaissance du métabolisme des médicaments chez un individu est un élément majeur pour prédire leur efficacité thérapeutique et leur toxicité. Aussi l'évaluation de l'activité des enzymes clés du métabolisme au moyen d'un test simple chez le patient (i.e. la caractérisation de son phénotype) permettrait un ajustement fin de la posologie. Pour réaliser un tel phénotypage, l'approche choisie consiste chez un patient à administrer un cocktail de molécules de référence, puis à doser chez ce patient la pharmacocinétique des substrats et des métabolites par spectrométrie de masse afin, in fine, de modéliser les activités des enzymes du métabolisme de manière personnalisée. Sujet proposé Au sein de notre laboratoire, le projet confié au (à la) post-doctorant(e) consistera à développer un module logiciel de traitement, d’analyse et d’exploitation des données à partir des dosages mesurés et/ou issus de la littérature (substrats et métabolites) ainsi que de plusieurs co-variables. Dans un premier temps, le travail d’analyse des données et de modélisation statistique (par exemple en langage R ou C++) portera sur les résultats expérimentaux obtenus in vitro et in vivo afin de valider la faisabilité de la méthode. Dans un deuxième temps, le (la) post-doctorant(e) participera au dimensionnement de l'étude clinique destinée à recueillir la base de données chez l'homme. L'objectif final est de prédire, à partir d'un simple prélèvement chez un patient : 1. les activités enzymatiques de ce patient 2. la posologie optimale d'un nouveau médicament que le médecin souhaite lui administrer. Profil recherché Nous recherchons un(e) candidat(e) ayant effectué son doctorat en mathématiques appliquées (statistiques, optimisation) et très motivé(e) par l'analyse des données de l'expérimentation biologique, en vue d'une application clinique. Nature du contrat de travail : CDD Type de contrat de travail : Droit privé Durée du contrat : 2 ans (1 an renouvelable 1 fois) Salaire : environ 2700 € brut/mois Note Les candidats sont invités à vérifier qu'ils remplissent tous les critères requis pour les post-doctorats dont le CEA est employeur ( http://www-instn.cea.fr/rubrique.php3?id_rubrique=68 ). II. Modalité de dépôt de candidature Merci d'envoyer le CV détaillant l'expérience acquise et incluant la liste des publications, ainsi que la lettre de motivation, à : Etienne Thévenot +33 (0) 1 69 08 79 23 [EMAIL PROTECTED] Laboratoire Modélisation, Mesure et Analyse Commissariat à l'Energie Atomique, LIST/DETECS/SSTM, 91191 Gif-sur-Yvette cedex, France # English: #-------- Post-doctoral position at CEA Saclay (France, Paris region): Applied mathematics to pharmacokinetic data statistics and prediction of drug metabolism in human Background: Health and information technologies are a major focus of the CEA ( http://www.cea.fr/english_portal ), as a prominent player in European technological research ( http://www.cea.fr/english_portal ). Mathematics, life sciences and computing are part of the interdisciplinary scientific expertise at the Saclay research centre (5,000 researchers and collaborators). The Department of Sensor and Signal Processing ( http://www-list.cea.fr/gb/index_gb.htm ) focuses on the design of new sensors, the development of intelligent associated instrumentation, and the development of high-performance hardware and software architectures to process large volumes of data in real time. Project: Drug metabolism in the human body is of major importance for assessing therapeutic effects and toxicity. Determining the activities of the key enzymes of a patient (i.e. its phenotype) with a simple test would therefore be of great value for drug dosage. In collaboration with the Department of Medical Research, the project aims at 1) measuring the substrates and metabolites amounts by mass spectrometry after administration of a minimal drug cocktail to the patient and 2) modeling the activities of the targeted enzymes. Job description: In our laboratory, the post holder will develop a statistical software application for modeling the enzymatic activities based on mass spectrometry measures and patient characteristics (covariates) by using population pharmacokinetics. Programming languages will include R and C++. Firstly, (s)he will build and validate the statistical model on experimental in vitro and in vivo data. Secondly, (s)he will participate to the sampling strategy of a clinical trial aimed at collecting human data. Finally, (s)he will apply the model to "personalized" dosage prediction before administration of a new drug to a patient. Profile: Interested applicants should hold a Ph.D. in biostatistics or applied mathematics (statistics, optimization) with experience in biological data analysis, and be highly motivated by multidisciplinary team work with biologists aiming at clinical application. Our offer: 2-year contract (1 year renewable once). Nature of the contract of employment: Fixed-term Type of contract of employment: Private Salary: net salary: about 2200 €/month, depending on experience. Application: Please send a detailed CV including the list of publications, a motivation letter and two letters of recommendation to Dr. Etienne Thévenot [EMAIL PROTECTED] +33 (0)1 69 08 79 23 Data Modelling, Acquisition and Analysis Laboratory CEA Saclay, DRT/LIST/DETECS/SSTM/L2MA, 91 191 Gif-sur-Yvette cedex, France Note: The candidate should not have presented his PhD thesis more than two years before the starting date and should have a good record of scientific publications. -- Etienne Thévenot, Ph.D. Laboratoire de Modélisation, Mesure et Analyse (Data Modelling, Acquisition and Analysis Laboratory) Commissariat à l'Energie Atomique (French Atomic Energy Commission) CEA Saclay, DRT/LIST/DETECS/SSTM/L2MA, bât. 516 91191 Gif-sur-Yvette cedex France Phone: +33 (0)1 69 08 79 23 Fax: +33 (0)1 69 08 60 30 E-mail : [EMAIL PROTECTED]