Re: ADVAN6 coding question

From: Sam Liao liao@pharmaxresearch.com Subject: Re: [NMusers] ADVAN6 coding question Date: Fri, 24 Mar 2006 19:19:18 -0500 Hi Garry: I have a nmv control file and the data set I used to simulate Bauer's PKPD model. Hope this can be helpful to you to write your model and preparing your input file. $PROB A INDIRECT INHIBITION PK/PD MODEL, Raptiva human $INPUT ID AMT TIME RAP=DV CMT $DATA SIM1.PRN $SUBROUTINES ADVAN8 TOL=5 $MODEL NCOMP=3 COMP=(CENTRAL) COMP=(PERI) COMP=(CD11A) $PK CALLFL=1 VC=THETA(1)*EXP(ETA(1)) K12=THETA(2) K21=THETA(3) K10=THETA(4) K03=THETA(5) K30=K03/100 VM=THETA(6) VM2=THETA(7) KM=THETA(8) S1=VC S3=1 F3=100 ;BOUNDARY CONDITION FOR EQUATION 1 ; K30=THETA(9) $DES DADT(1)= K21*A(2) - (K12 + K10)*A(1) -VM*A(1)*A(3)/(KMC*VC +A(1)) DADT(2)= - K21*A(2) + K12*A(1) DADT(3)= K03 - K30*A(3) -VM2*A(1)*A(3)/(KMC*VC +A(1)) $ERROR Y= F + EPS(1) $THETA 0.072 ;1 Vc in L/kg 0.283 ;2 k12 in 1/d 0.506 ;3 k21 in 1/d 0.10 ;4 k10 in 1/d 43.5 ;5 k03 in %CD11a/d .00147 ;6 Vm in mg/kg/d/%CD11a 1.34 ;7 Vm2 in 1/d 0.248 ;8 Kmc in mg/L $OMEGA 0 FIX $SIGMA 0 FIX $SIM (243709) ONLY ;$EST POSTHOC SIG=5 MAXEVAL=9999 PRINT=10 MSFO=MSF1 ;$COV $TABLE ID TIME Y AMT CMT FILE=SIM1 ONEHEADER NOPRINT #ID AMT TIME DV CMT 1 0.3 0 . 1 1 1 0 . 3 1 . 0.5 . 1 1 . 0.5 . 3 1 . 1 . 1 1 . 1 . 3 1 . 1.5 . 1 1 . 1.5 . 3 1 . 2 . 1 1 . 2 . 3 1 . 2.5 . 1 1 . 2.5 . 3 1 . 3 . 1 1 . 3 . 3 1 . 3.5 . 1 1 . 3.5 . 3 1 . 4 . 1 1 . 4 . 3 1 . 4.5 . 1 1 . 4.5 . 3 1 . 5 . 1 1 . 5 . 3 1 . 5.5 . 1 1 . 5.5 . 3 1 . 6 . 1 1 . 6 . 3 1 . 6.5 . 1 1 . 6.5 . 3 1 . 7 . 1 1 . 7 . 3 1 . 7.5 . 1 1 . 7.5 . 3 1 . 8 . 1 1 . 8 . 3 1 . 10 . 1 1 . 10 . 3 1 . 12 . 1 1 . 12 . 3 1 . 14 . 1 1 . 14 . 3 1 . 16 . 1 1 . 16 . 3 1 . 18 . 1 1 . 18 . 3 1 . 20 . 1 1 . 20 . 3 1 . 22 . 1 1 . 22 . 3 1 . 24 . 1 1 . 24 . 3 1 . 26 . 1 1 . 26 . 3 1 . 28 . 1 1 . 28 . 3 1 . 30 . 1 1 . 30 . 3 1 . 32 . 1 1 . 32 . 3 1 . 34 . 1 1 . 34 . 3 1 . 36 . 1 1 . 36 . 3 1 . 38 . 1 1 . 38 . 3 1 . 40 . 1 1 . 40 . 3 1 . 45 . 1 1 . 45 . 3 1 . 50 . 1 1 . 50 . 3 1 . 55 . 1 1 . 55 . 3 1 . 60 . 1 1 . 60 . 3 1 . 65 . 1 1 . 65 . 3 1 . 70 . 1 1 . 70 . 3 1 . 75 . 1 1 . 75 . 3 1 . 80 . 1 1 . 80 . 3 1 . 85 . 1 1 . 85 . 3 1 . 90 . 1 1 . 90 . 3 2 1 0 . 1 2 1 0 . 3 2 . 0.5 . 1 2 . 0.5 . 3 2 . 1 . 1 2 . 1 . 3 2 . 1.5 . 1 2 . 1.5 . 3 2 . 2 . 1 2 . 2 . 3 2 . 2.5 . 1 2 . 2.5 . 3 2 . 3 . 1 2 . 3 . 3 2 . 3.5 . 1 2 . 3.5 . 3 2 . 4 . 1 2 . 4 . 3 2 . 4.5 . 1 2 . 4.5 . 3 2 . 5 . 1 2 . 5 . 3 2 . 5.5 . 1 2 . 5.5 . 3 2 . 6 . 1 2 . 6 . 3 2 . 6.5 . 1 2 . 6.5 . 3 2 . 7 . 1 2 . 7 . 3 2 . 7.5 . 1 2 . 7.5 . 3 2 . 8 . 1 2 . 8 . 3 2 . 10 . 1 2 . 10 . 3 2 . 12 . 1 2 . 12 . 3 2 . 14 . 1 2 . 14 . 3 2 . 16 . 1 2 . 16 . 3 2 . 18 . 1 2 . 18 . 3 2 . 20 . 1 2 . 20 . 3 2 . 22 . 1 2 . 22 . 3 2 . 24 . 1 2 . 24 . 3 2 . 26 . 1 2 . 26 . 3 2 . 28 . 1 2 . 28 . 3 2 . 30 . 1 2 . 30 . 3 2 . 32 . 1 2 . 32 . 3 2 . 34 . 1 2 . 34 . 3 2 . 36 . 1 2 . 36 . 3 2 . 38 . 1 2 . 38 . 3 2 . 40 . 1 2 . 40 . 3 2 . 45 . 1 2 . 45 . 3 2 . 50 . 1 2 . 50 . 3 2 . 55 . 1 2 . 55 . 3 2 . 60 . 1 2 . 60 . 3 2 . 65 . 1 2 . 65 . 3 2 . 70 . 1 2 . 70 . 3 2 . 75 . 1 2 . 75 . 3 2 . 80 . 1 2 . 80 . 3 2 . 85 . 1 2 . 85 . 3 2 . 90 . 1 2 . 90 . 3 3 3 0 . 1 3 1 0 . 3 3 . 0.5 . 1 3 . 0.5 . 3 3 . 1 . 1 3 . 1 . 3 3 . 1.5 . 1 3 . 1.5 . 3 3 . 2 . 1 3 . 2 . 3 3 . 2.5 . 1 3 . 2.5 . 3 3 . 3 . 1 3 . 3 . 3 3 . 3.5 . 1 3 . 3.5 . 3 3 . 4 . 1 3 . 4 . 3 3 . 4.5 . 1 3 . 4.5 . 3 3 . 5 . 1 3 . 5 . 3 3 . 5.5 . 1 3 . 5.5 . 3 3 . 6 . 1 3 . 6 . 3 3 . 6.5 . 1 3 . 6.5 . 3 3 . 7 . 1 3 . 7 . 3 3 . 7.5 . 1 3 . 7.5 . 3 3 . 8 . 1 3 . 8 . 3 3 . 10 . 1 3 . 10 . 3 3 . 12 . 1 3 . 12 . 3 3 . 14 . 1 3 . 14 . 3 3 . 16 . 1 3 . 16 . 3 3 . 18 . 1 3 . 18 . 3 3 . 20 . 1 3 . 20 . 3 3 . 22 . 1 3 . 22 . 3 3 . 24 . 1 3 . 24 . 3 3 . 26 . 1 3 . 26 . 3 3 . 28 . 1 3 . 28 . 3 3 . 30 . 1 3 . 30 . 3 3 . 32 . 1 3 . 32 . 3 3 . 34 . 1 3 . 34 . 3 3 . 36 . 1 3 . 36 . 3 3 . 38 . 1 3 . 38 . 3 3 . 40 . 1 3 . 40 . 3 3 . 45 . 1 3 . 45 . 3 3 . 50 . 1 3 . 50 . 3 3 . 55 . 1 3 . 55 . 3 3 . 60 . 1 3 . 60 . 3 3 . 65 . 1 3 . 65 . 3 3 . 70 . 1 3 . 70 . 3 3 . 75 . 1 3 . 75 . 3 3 . 80 . 1 3 . 80 . 3 3 . 85 . 1 3 . 85 . 3 3 . 90 . 1 3 . 90 . 3 4 10 0 . 1 4 1 0 . 3 4 . 0.5 . 1 4 . 0.5 . 3 4 . 1 . 1 4 . 1 . 3 4 . 1.5 . 1 4 . 1.5 . 3 4 . 2 . 1 4 . 2 . 3 4 . 2.5 . 1 4 . 2.5 . 3 4 . 3 . 1 4 . 3 . 3 4 . 3.5 . 1 4 . 3.5 . 3 4 . 4 . 1 4 . 4 . 3 4 . 4.5 . 1 4 . 4.5 . 3 4 . 5 . 1 4 . 5 . 3 4 . 5.5 . 1 4 . 5.5 . 3 4 . 6 . 1 4 . 6 . 3 4 . 6.5 . 1 4 . 6.5 . 3 4 . 7 . 1 4 . 7 . 3 4 . 7.5 . 1 4 . 7.5 . 3 4 . 8 . 1 4 . 8 . 3 4 . 10 . 1 4 . 10 . 3 4 . 12 . 1 4 . 12 . 3 4 . 14 . 1 4 . 14 . 3 4 . 16 . 1 4 . 16 . 3 4 . 18 . 1 4 . 18 . 3 4 . 20 . 1 4 . 20 . 3 4 . 22 . 1 4 . 22 . 3 4 . 24 . 1 4 . 24 . 3 4 . 26 . 1 4 . 26 . 3 4 . 28 . 1 4 . 28 . 3 4 . 30 . 1 4 . 30 . 3 4 . 32 . 1 4 . 32 . 3 4 . 34 . 1 4 . 34 . 3 4 . 36 . 1 4 . 36 . 3 4 . 38 . 1 4 . 38 . 3 4 . 40 . 1 4 . 40 . 3 4 . 45 . 1 4 . 45 . 3 4 . 50 . 1 4 . 50 . 3 4 . 55 . 1 4 . 55 . 3 4 . 60 . 1 4 . 60 . 3 4 . 65 . 1 4 . 65 . 3 4 . 70 . 1 4 . 70 . 3 4 . 75 . 1 4 . 75 . 3 4 . 80 . 1 4 . 80 . 3 4 . 85 . 1 4 . 85 . 3 4 . 90 . 1 4 . 90 . 3 Best regards, Sam Liao Pharmax Research 201-9882043